| N | Torneo | Jornada | Fecha | Local | Result. | Visita | Estadio | Arbitro | Público | Fuente | Obs |
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| 1 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 1 | 15/09/2016 | Villarreal | 2 - 1 | FC Zurich | El Madrigal,, Villarreal | Sébastien Delferière (Belgium) | 16384 | [85] | |
| 2 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 2 | 29/09/2016 | Steaua Bucuresti | 1 - 1 | Villarreal | Arena Națională,, Bucharest | Ievgenii Aranovskyi (Ukraine) | 13231 | [85] | |
| 3 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 3 | 20/10/2016 | Osmanlispor | 2 - 2 | Villarreal | Osmanlı Stadyumu,, Ankara | Liran Liany (Israel) | 11692 | [85] | |
| 4 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 4 | 03/11/2016 | Villarreal | 1 - 2 | Osmanlispor | El Madrigal,, Villarreal | Harald Lechner (Austria) | 15386 | [85] | |
| 5 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 5 | 24/11/2016 | FC Zurich | 1 - 1 | Villarreal | Letzigrund,, Zürich | Davide Massa (Italy) | 10069 | [85] | |
| 6 | UEFA Europa League 2016/17 | Grupo L - 6 | 08/12/2016 | Villarreal | 2 - 1 | Steaua Bucuresti | El Madrigal,, Villarreal | Manuel Gräfe (Germany) | 19471 | [85] | |
| 7 | UEFA Europa League 2016/17 | Dieciseisavos de final - 1 | 16/02/2017 | Villarreal | 0 - 4 | Roma | Estadio de la Cerámica, Villarreal | Danny Makkelie (Netherlands) | 17960 | [85] | |
| 8 | UEFA Europa League 2016/17 | Dieciseisavos de final - 2 | 23/02/2017 | Roma | 0 - 1 | Villarreal | Stadio Olimpico, Rome | Felix Zwayer (Germany) | 19495 | [85] | |
